Ciencia

‘Deltacron’: contaminación de laboratorio probablemente responsable del híbrido Delta y Omicron, dicen los científicos

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Una aparente cepa de coronavirus que combina mutaciones de las variantes Omicron y Delta probablemente sea el resultado de la contaminación de laboratorio, dijeron los científicos.

Durante el fin de semana surgieron temores de que una nueva cepa de Covid, denominada ‘Deltacron’, hubiera surgido de un llamado evento de recombinación, cuando dos variantes coinfectan a un paciente e intercambian mutaciones para producir una nueva descendencia viral.

Hasta la fecha se han informado veinticinco secuencias de Deltacron, pero los expertos han insistido en que no hay evidencia que sugiera que Omicron y Delta se hayan combinado para generar una nueva variante.

“Es casi seguro que esto no es un recombinante biológico de los linajes Delta y Omicron”, dijo el Dr. Jeffrey Barrett, director de la Iniciativa de Genómica Covid-19 en el Instituto Wellcome Sanger.

En cambio, se ha sugerido que fragmentos de Omicron se han insertado accidentalmente en la estructura genética de Delta durante el proceso de secuenciación que tiene lugar al intentar identificar una infección variante de Covid.

Este es un error común que puede ocurrir en cualquier laboratorio, dijo Aris Katzourakis, profesor de evolución y genómica en la Universidad de Oxford.

Explicó que, al secuenciar un virus, su genoma se divide en fragmentos genéticos y luego se analiza antes de volver a ensamblarlo en una computadora.

Sin embargo, un fragmento particular de Delta es propenso a “desaparecer” durante el proceso de secuenciación y es “sensible a la contaminación”. En el caso de las 25 muestras ‘Deltacon’, parece que este espacio en particular se había llenado con un fragmento de Omicron, dijo el profesor Katzourakis.

“Este es un signo revelador de contaminación de laboratorio que da la impresión de recombinación”.

El Dr. Barrett dijo que las mutaciones de Deltacron que parecían haber derivado de Omicron estaban ubicadas “precisa y exclusivamente” en el fragmento del genoma de Delta que está “afectado por un artefacto tecnológico en ciertos procedimientos de secuenciación”.

Las 25 muestras informadas a Gisaid, una base de datos de variantes global, se procesaron en múltiples procedimientos de secuenciación en más de un país, según Leondios Kostrikis, profesor de ciencias biológicas en la Universidad de Chipre que identificó por primera vez a Deltacron.

“Estos hallazgos refutan las declaraciones indocumentadas de que Deltacron es el resultado de un error técnico”, dijo el profesor Kostrikis.

Sin embargo, el profesor Katzourakis dijo que el proceso de combinar accidentalmente fragmentos de variantes al secuenciar lotes de muestras de Covid en un laboratorio era “un error común”. “Sucede todo el tiempo”, agregó.

“No es que sea imposible que ocurra la recombinación entre variantes. Simplemente, esto no es prueba de ello.

“Si fue un evento de recombinación real, cuando haces un árbol de secuencias Delta y Deltracron, las secuencias Deltacon deberían formar una rama distinta en ese árbol, indicativo de su ascendencia común.

“Lo que ves en cambio, es una mezcla de las secuencias Deltacron dentro del árbol Delta. Esto significa que no forman un linaje distinto “.

Independientemente de cómo llegó a ser, los expertos y funcionarios no están preocupados por Deltacron.

“No es uno de lo que preocuparse”, dijo el profesor David Matthews, virólogo de la Universidad de Bristol.

El ministro de salud chipriota, Michael Hadjipantela, dijo el domingo que Deltacron no es motivo de preocupación y que se darán más detalles en una conferencia de prensa más adelante en la semana.

El profesor Lawrence Young, virólogo de la Universidad de Warwick, dijo que el enfoque de la comunidad científica más amplia debe estar en cómo “manejamos la inevitable aparición de nuevas variantes y cómo se validan y notifican”.

“Las variantes seguirán apareciendo mientras el virus continúe propagándose en regiones subvacunadas. Por eso es tan importante la vacunación mundial ”.

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